V tom istom roku vydal s výtvarníkom Alanom Lesykom rozprávkovú knihu Puki.
Poviedky, črty a príležitostné rozprávania, ktoré väčšinou odzneli v rozhlasovej relácii Pálenica Borisa Filana vydal knižne pod názvom Ľubošova finta (2005). V roku 2006 sa prezentoval románom Wewerka, ktorý je príbehom dievčaťa hľadajúceho svojho otca. Medzi prozaické Filanove diela sa radí aj kniha Bratislavské krutosti (2008).
Je tiež autorom ľúbostného románu Klimtov bozk (2008). Voľným pokračovaním Bratislavských krutostí je kniha PrešpoRock (2010). Tretia kniha bratislavských príbehov nesie názov Raba Suli. Bratislava III. (2011).
Nevšedné cestovateľské reportáže zhrnul v mnohých knihách ako Tam Tam (1993), Tam Tam 2 (1995), Tam Tam 3 (1999), Nočný Tam Tam (2002), Posledný Tam Tam (2004) či Tam Tam Plus (2007). Medzi jeho cestopisné knihy patria publikácie Dole vodou (2009), Tajomstvo Budhovho úsmevu (2010), Ako išlo oko na vandrovku (2012), Umenie zablúdiť (2014), Rozhovor s tigrom (2015), Káva od Felliniho (2017) či ŠirokoĎaleko (2019).
Zbierky rôznorodých textov predstavujú zasa knihy Po vtákoch (2015), Zabíjačka a iné rozkoše (2012, 2020), či Hodina človečiny (2018).
Na svoje dlhoročné priateľstvo a spoločné zážitky so spevákom Jožom Rážom sa zameral v knihe Cigary idú do neba (2022).
Boris Filan je držiteľom mnohých ocenení. Za publicistickú aktivitu dostal v roku 1994 cenu Egona Erwina Kischa. V roku 2009 získal cenu Zlaté pero 2009 za najhodnotnejšie pôvodné dielo s knihou Dole vodou. Ľúbostný román Klimtov bozk sa stal Knihou roka 2009. V januári 2011 sa stal laureátom Krištáľového krídla za rok 2010 v kategórii publicistika a literatúra za knihu PrešpoRock. Veľkú cenu SOZA za celoživotné dielo dostal v novembri 2014.
Je ženatý s herečkou Ingrid Žirkovou a je otcom dvoch synov.
